某天外星不明熱汽球狀飛行船突然降臨全球各國，引發騷動與恐慌，美國政府派出有軍人與科學家的團隊駐點調查。
陸軍上校韋伯要求優秀的語言學博士露易絲 (艾美亞當斯 飾)，與物理學家伊恩(傑瑞米·雷納 飾)加入這個團隊，解悉外星語言尋求解答和溝通，進而知道他們是誰，來自何處以及為何來到地球，也要研究他們擁有的科技。
露易絲與伊恩跟隨團隊進入太空船中，與兩個只能看到一部分外觀的外星人隔著玻璃進行接觸。
露易絲引導外星人使用他們的文字作為書面語言，進而得知外星人的文字是一種複雜的圓形符號，於是她開始學習那些符號相對應的涵義。
在彼此奇妙的接觸過程中，露易絲開始看到似夢又像未來的幻境。
悲傷萬分的露易絲，看著她躺臥病床上的女兒漢娜，她看見了伊恩將是漢娜的父親，她在女兒八歲時告訴伊恩，女兒會在十二歲時死於一種無法治療的疾病，伊恩無法接受這個事實，指責露易絲不該明知結局，卻還和他結婚並生下漢娜，害怕承受失去女兒的悲痛，選擇離她們母女而去。
此時，中國的沈將軍決定攻擊在上海的太空船，俄羅斯也打算跟進攻擊在境內的太空船。
露易絲單獨進入太空船，她不再隔著玻璃與對方接觸，而是面對面看到了暱稱「科斯特洛」的外星人全貌，他用符號告訴她另一名外星人「阿波特」被爆炸波及正在死去。露易絲問及有關她所看見的小女孩的幻象，「科斯特洛」說明她的「幻象」是「預見未來」。
他們來到地球是分享他們的文字作為給人類的「禮物」，這就是他們所指的「工具」或「技術」而不是人類解讀的「武器」，這些文字可以改變心靈思維對時間的感知，隨著逐漸熟悉使用便可以「預見未來」。
「科斯特洛」告訴露易絲3000年後的未來，他們種族會需要人類的幫助以作為分享文字的回報，這就是他們來地球的目的。
「科斯特洛」要求露易絲利用她能看到未來的能力，來解決現在的局面。
人類對外星人因無知而恐懼，不知為什麼好萊塢科幻片，都安排外星人一定要攻打地球毀滅人類？這樣外星人能得到什麼好處呢？
《異星入境 》不是科幻片，而是預言故事，藉語言學家以善意對待，文明溝通，給予外星人新的定義，了解他們來地球不是只有帶來暴力與搞破壞。
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